由于目前我国近年来化肥的大量使用，使得农业生产发生了巨大的变化，在带来巨大经济效益和满足人口急剧增长需求的同时， 随后它的负面影响也在日后渐渐地暴露出他的缺点，比如；土壤的地力下降、环境质量恶化、食品质量安全事故时有发生等。现在，人们对有机肥又开始重新重视起来。希望餐桌上的食物是无害的、无化肥的掺加。
但是有机肥的不合理使用也会在土壤质量、环境质量以及食品安造成负面影响，如不引起足够重视，其副作用甚至超过化肥。土壤质量是指土壤维持作物生产能力、保持环境质量及促进动植物健康的能力。因此，有机肥的使用将从正反两个方面强烈影响土壤质量。
在现代农业生产中，有机肥料的施用不仅直接关系到土壤质量、农作物的产量和品质、水体和大气环境质量，而且它还是种植业与养殖业之间的重要纽带，对促进农田生态系统和生物圈中的物质循环与能量转化也有重要作用。有机肥种类繁杂，性质各异，为了充分发挥有机肥的正向作用而尽量减少其负面影响，我们必须对各种有机肥的特性、在土壤中的转化过程及其对土壤、环境质量和农作物的影响有较清晰的了解，从而制订科学的施用规范。
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